Prototype 2 (хоумбрю)

Сержант Джеймс Хеллер возвращается с войны и узнаёт, что его жена и дочь погибли во вспышке вируса «Блэклайт», захлестнувшей Нью-Йорк. Виновным в трагедии он считает Алекса Мерсера, героя первой части, и отправляется мстить — но при встрече Мерсер заражает Хеллера той же заразой, превращая его в такого же оборотня-мутанта, каким когда-то стал он сам, и Prototype 2 превращается уже в историю мести самого Хеллера.

Главный инструмент героя — собственное тело: он поглощает людей, перенимая их облик и воспоминания, благодаря чему может незаметно проникать на охраняемые объекты или выуживать информацию о заговоре корпораций Gentek и Blackwatch. В остальное время Хеллер носится по карантинной зоне города без всяких ограничений — взбегает по стенам небоскрёбов, планирует между крышами, угоняет танки и вертолёты и голыми руками раскидывает вражеские отряды.

По мере прокачки у героя открываются новые мутации и приёмы для совершенно разных стилей игры — кто-то предпочитает скрытность и подмену личности, кто-то устраивает лобовой штурм военных баз. Отдельные подземные арены-«логова», разбросанные по городу, дают возможность отработать боевые комбо и получить дополнительные апгрейды для дальнейших сражений.